Euroopa Kontrollikoja eriaruande kohaselt ei ole EIP AGRI suutnud oma täit potentsiaali ära kasutada. Kuigi aastatel 2014–2022 eraldati vahendist uuenduslike põllumajandustavade edendamiseks ligi 1 miljard eurot ELi ja liikmesriikide raha, ei suudetud sageli luua kasulikke, praktilisi või laialdaselt kasutusele võetud uuendusi.